Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms