Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms