Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEMP2A6NFY4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms