Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XIRP2A4UGR9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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