Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms