Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM2AQ9Y2K7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms