Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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