Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VPS4AQ9UN37 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS4AQ9UN37 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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