Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf42Q9NWW7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms