Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms