Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms