Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms