Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms