Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms