Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms