Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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