Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms