Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ZNF548Q8NEK5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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