Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TTC21AQ8NDW8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC21AQ8NDW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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