Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms