Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms