Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSSK4Q6SA08 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms