Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO4Q6EEV6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms