Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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