Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NDUFA9Q16795 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA9Q16795 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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