Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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