Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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