Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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