Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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