Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms