Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms