Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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