Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms