Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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