Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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