Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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