Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 YWHAH-204ENST00000443669 822 ntTSL 327.6■■■□□ 2.015e-9■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.577e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.427e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 GIPC1-204ENST00000585606 2071 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.977e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.97e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CD151-221ENST00000532075 786 ntTSL 220.17■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.457e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.417e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.47e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.397e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.397e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.377e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.217e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.197e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 LAMP1-202ENST00000471046 424 ntTSL 315.95■□□□□ 0.147e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-223ENST00000496360 2080 ntTSL 215.83■□□□□ 0.134e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-207ENST00000442046 2299 ntTSL 515.24■□□□□ 0.034e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RHBDD2-208ENST00000468644 555 ntTSL 415.12■□□□□ 0.017e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-202ENST00000360115 2824 ntTSL 514.45□□□□□ -0.14e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-208ENST00000446276 2559 ntTSL 513.66□□□□□ -0.224e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 YWHAH-206ENST00000479649 662 ntTSL 313.64□□□□□ -0.235e-9■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 513.57□□□□□ -0.247e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.317e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-225ENST00000497807 2689 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.354e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.387e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RHBDD2-205ENST00000466232 566 ntTSL 411.55□□□□□ -0.567e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RNF145-204ENST00000518284 1940 ntTSL 210.74□□□□□ -0.697e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.737e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.877e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.997e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 WDR45B-209ENST00000576517 779 ntTSL 38.83□□□□□ -17e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 46.82□□□□□ -1.321e-13■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-209ENST00000484653 747 ntTSL 56.52□□□□□ -1.377e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.377e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PABPN1-204ENST00000554062 589 ntTSL 36.42□□□□□ -1.387e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.41□□□□□ -1.384e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.414e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-207ENST00000478963 587 ntTSL 25.73□□□□□ -1.497e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-205ENST00000460085 558 ntTSL 25.2□□□□□ -1.587e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.594e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.694e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 24.15□□□□□ -1.747e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.754e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.84e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 53.78□□□□□ -1.81e-13■■□□□ 12
PABPC4Q13310 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.942e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 FAM89A-203ENST00000494111 1576 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 FAM89A-202ENST00000466258 983 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 29.3□□□□□ -0.925e-19■■□□□ 12
PABPC4Q13310 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -12e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.141e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt17.54■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PSMD11-203ENST00000469475 473 ntTSL 217.24■□□□□ 0.358e-19■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-203ENST00000525274 671 ntTSL 329.68■■■□□ 2.341e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.091e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPP21-225ENST00000466327 697 ntTSL 328.03■■■□□ 2.088e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C8orf82-205ENST00000534680 1637 ntTSL 527.48■■□□□ 1.998e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.818e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.748e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.698e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.688e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.648e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.628e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-204ENST00000497128 914 ntTSL 225.12■■□□□ 1.618e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-203ENST00000486081 1135 ntTSL 524.79■■□□□ 1.568e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-213ENST00000531006 860 ntTSL 224.65■■□□□ 1.541e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-209ENST00000635952 853 ntTSL 324.57■■□□□ 1.528e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.478e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.48e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-215ENST00000532308 951 ntTSL 523.73■■□□□ 1.391e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.358e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-222ENST00000637222 1048 ntTSL 523.13■■□□□ 1.298e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-210ENST00000636029 740 ntTSL 523.03■■□□□ 1.288e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CC2D1A-204ENST00000587508 1667 ntTSL 522.67■■□□□ 1.228e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-211ENST00000529899 568 ntTSL 222.44■■□□□ 1.181e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SMUG1-208ENST00000504797 470 ntTSL 321.62■■□□□ 1.051e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SMUG1-218ENST00000511522 561 ntTSL 321.57■■□□□ 1.041e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.018e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.998e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.978e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PML-218ENST00000567606 2042 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.961e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.968e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-204ENST00000526290 488 ntTSL 320.38■□□□□ 0.851e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.788e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.734e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TSTA3-206ENST00000527549 575 ntTSL 219.4■□□□□ 0.71e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.668e-7■■□□□ 12
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