Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NME3Q13232 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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