Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms