Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGEF5Q12774 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGEF5Q12774 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF5Q12774 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms