Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SYCNQ0VAF6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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