Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL30Q0D2K2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms