Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms