Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms