Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms