Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms