Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms