Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB1P82279 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB1P82279 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms