Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCL8P80075 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL8P80075 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms