Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBA1P69905 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HBA1P69905 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms